Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SptssbQ925E8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms