Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim7Q923T7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms