Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms