Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubb6Q922F4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms