Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rpe65Q91ZQ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpe65Q91ZQ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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