Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc49Q91YK0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms