Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx4Q91YJ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx4Q91YJ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms