Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms