Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApofQ91V80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms