Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx18Q8VDS8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Stx18Q8VDS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Stx18Q8VDS8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx18Q8VDS8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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