Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Uhrf1Q8VDF2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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