Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a8Q8R4D1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms