Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln1Q8R317 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ubqln1Q8R317 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubqln1Q8R317 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ubqln1Q8R317 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln1Q8R317 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ubqln1Q8R317 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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