Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r200Q8R281 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Vmn1r200Q8R281 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn1r200Q8R281 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn1r200Q8R281 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r200Q8R281 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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