Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Impg1Q8R1W8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Impg1Q8R1W8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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