Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Neil3Q8K203 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Neil3Q8K203 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms