Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms