Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SbsnQ8CIT9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SbsnQ8CIT9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SbsnQ8CIT9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SbsnQ8CIT9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SbsnQ8CIT9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms