Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx8Q8CFD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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