Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms