Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc17Q8CE13 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms