Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ephb1Q8CBF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb1Q8CBF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms