Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dclre1bQ8C7W7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms