Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp20Q8C6M1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp20Q8C6M1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms