Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cwc22Q8C5N3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cwc22Q8C5N3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms