Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms