Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IrgcQ8C262 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IrgcQ8C262 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms