Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms