Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc44a2Q8BY89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc44a2Q8BY89 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms