Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trerf1Q8BXJ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trerf1Q8BXJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms