Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrfn5Q8BXA0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn5Q8BXA0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms