Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmod1Q8BVA4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmod1Q8BVA4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms