Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Prpf18Q8BM39 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf18Q8BM39 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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