Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabra5Q8BHJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms