Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ubash3bQ8BGG7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ubash3bQ8BGG7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ubash3bQ8BGG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubash3bQ8BGG7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ubash3bQ8BGG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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