Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClspnQ80YR7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClspnQ80YR7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms