Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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