Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh3b1Q80VQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh3b1Q80VQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms