Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul9Q80TT8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul9Q80TT8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms