Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT15

Galnt17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt17Q7TT15 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Galnt17Q7TT15 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Galnt17Q7TT15 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms