Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PhkbQ7TSH2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms