Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdp1Q7TSG2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms