Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms