Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms