Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms