Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rph3alQ768S4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rph3alQ768S4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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