Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2d2bQ6ZWY6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms