Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27Q6ZWU9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps27Q6ZWU9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms