Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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