Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms